Das stimmt. Wer einen Standard - Boxed Lüfter hat kann ihn so runterregeln.
Aber das kann man auch, ohne nhc und runtertakten. Die allermeisten Mainboards benötigen eh eine "Mindestdrehzahl", den CPU Lüfter wird man nicht ohne weiteres anhalten können.
Die Lüfter haben aber, wenn man nicht gerade übertaktet, einen gewissen Spielraum. Mit Speedfan o.ä. kriegt man jeden Mainboardlüfter halbwegs leise.
Und wie du schreibst, sehr oft ist auch nicht der CPU-Lüfter schuld sondern der Mainboardlüfter, ganz gerne mal die Grafikkarte und last but not least das netzteil. Und die bleiben laut

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Also gleich was gutes kaufen oder Wasserkühlung und fertig ist.
Liebe Grüße
Skysmo